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Le rôle des champignons forestiers est mieux connue grâce à la génomique
Sciences Et Avenir -
02/11
Grace au séquençage à haut débit, les scientifiques commencent à répertorier les espèces de champignons vivant dans le sol et à mieux comprendre leurs fonctions. Une équipe franco-chinoise vient ainsi de publier ses résultats.
SYMBIOSE. C’est une vraie boîte noire, explorée depuis dix ans. Aux manettes, l’équipe très solide et expérimentée composée par des chercheurs français de l’Institut national pour la recherche sur l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (Inrae) et des Universités de Lorraine et d’Aix-Marseille et leurs homologues chinois de l’Université de Pékin et de l’Institut de botanique de Kunming dans la province du Yunnan. Dans leur article paru dans la revue scientifique Microbiome, ces chercheurs décrivent non seulement les liens étroits entre espèces de champignons symbiotiques et espèces d’arbres mais également les fonctions qu’ils remplissent.
Les avancées de la métatranscriptomique
Une prouesse qui n’aurait pas pu être accomplie sans la métatranscriptomique, le séquençage à haut débit de l’ARN messager des multiples habitants des premiers centimètres de sols. "Jusqu’à présent, nous étions incapables de dire quelle espèce contribuait à quelle fonction, ni de prévoir la façon dont les champignons les ajustaient selon le milieu ou le type d’arbre dominant dans les conditions naturelles des peuplements forestiers matures. C’est cette étape qui vient d’être franchie", se réjouit Francis Martin, chercheur à l’unité de recherc... [Courte citation de 8% de l'article original]
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